霍格沃茨魔法学院位于英国苏格兰哥特式风格的霍格沃茨城堡，它的确切位置不能确定，因为这里不可标绘。相似地，大多数魔法学校的地点都是保密的，这样能够保证各自的秘密不被外人知晓，同时保护学生和学校本身不会受到外来的侵害。
有魔法能力的孩子在出生时就被登记下来，他们会在11岁时收到猫头鹰寄来的录取通知书。
霍格沃茨学院共分为四个学院，分别是格兰芬多、赫奇帕奇、拉文克劳和斯莱特林，四个学院皆有其代表颜色与动物。新生入学后，第一件事情就是戴上分院帽进行分院，分院帽会根据你的性格和品质来判断你该属于哪一个学院。
霍格沃茨是一所全日制寄宿学校，位于英国苏格兰的某个黑湖旁的。
城堡中。城堡外有一片宽阔的草地，还有花坛和菜园。城堡边有一个黑湖、一片茂密的禁林、几座温室和其他一些附属建筑，这里也有猫头鹰棚屋，学生和学校拥有的猫头鹰全部居住在这里。除此之外，还有一座标准的魁地奇球场。
霍格沃茨城堡最高的三座塔楼分别是天文塔、拉文克劳塔和格兰芬多塔。城堡共有142处台阶，这些台阶有的又宽又大，有的又窄又小、摇摇晃晃；有的每逢星期五就通到不同的地方；有些上到半截，一个台阶会突然消失，因此，要记住在什么地方应当跳过去，另外，这里还有许多门，并且墙壁上挂有很多画像和相片。门上画像中的人物作为看守者，如果，你不客客气气地请它们打开，或者确切地捅对地方，它们是不会为你开门的；还有些门根本不是真正的门，只是一堵堵貌似门的坚固的墙壁。想要记住哪些东西在什么地方很不容易，城堡中的一切都在“不停地移动”，包括所有的楼梯台阶。前校长阿不思·邓布利多曾说就连自己也不知道霍格沃茨城堡的所有秘密，因为这座城堡历史悠久。
所有巫师在霍格沃茨中都无法幻影移形，他们只可以使用飞天扫帚或飞路粉，或者搭乘骑士公共汽车或幻影移形到学校附近的地点，再步行到达学校。霍格沃茨的学生开学时，需要搭乘霍格沃茨特快列车到达霍格莫德车站，新生通过仿照千年前四大创办者划船的方式，渡湖到达霍格沃茨，老生则乘坐夜骐拉的马车到达学校。霍格沃茨附近被施了麻瓜驱逐咒，让麻瓜无法接近这里。他们看不到学校的样子，只能看见一堆破败的废墟，还有入口处写着“危险，不得进入，不安全”的牌子。麻瓜的电子仪器和设备都不能在霍格沃茨使用，因为霍格沃茨周围充满强烈的魔法磁场，会对电子设备产生强烈的干扰，但是，无线电设备除外，因为魔法世界使用的无线电设备并不是通过电力启动，而是靠魔法。
学生在校有优异表现或贡献，除了能为自己的学院赢得分数外，也有可能获得“特殊贡献奖”。汤姆·里德尔、哈利·波特、罗恩·韦斯莱都曾获得此奖项。相反，若触犯校规，不但会被扣分，还有可能被关禁闭；关禁闭有很多种形式，例如：不用魔法进行清洁工作、或协助猎场看守鲁伯·海格到禁林巡逻等。
霍格沃茨学院是公元990年左右创办的。创办者是当时最伟大的四位巫师：戈德里克·格兰芬多、萨拉查·斯莱特林、罗伊纳·拉文克劳、赫尔加·赫奇帕奇。学校的四个学院就是以他们的名字命名的。他们建立学校，远离麻瓜们窥视的目光，因为，在当时那个年代，麻瓜们畏惧魔法，很多男女巫师都遭到迫害。他们每个人都有自己的个性，并在挑选学生时展现出来。可是，慢慢地，他们之间就有了分歧。萨拉查·斯莱特林就血统成分的问题，和另外三人发生了分歧。萨拉查·斯莱特林只希望招收纯血统的学生。不久后，萨拉查·斯莱特林和戈德里克·格兰芬多因为这个问题，发生了一次激烈的争吵，然后萨拉查·斯莱特林便离开了学校。离校前，萨拉查·斯莱特林在城堡里建了一个密室，其他创办者对此一无所知。萨拉查·斯莱特林封闭了密室，直到他真正的继承人来到学校，只有那个继承人能够开启密室，把里面的恐怖东西放出来，让它“净化”学校，清除所有不配学习魔法的人（麻瓜出身的巫师）。
在学校创办了大约三百年之后，在欧洲三所最有名望的魔法学校之间，开始了三强争霸赛：霍格沃茨魔法学校、布斯巴顿魔法学校和德姆斯特朗魔法学校。这比赛被认为是不同国籍的巫师相互交流切磋的最佳方式。比赛延续了六个世纪，后来，因为死亡人数太高，比赛被中断了。
1942年，密室被汤姆·里德尔第一次打开，他是萨拉查·斯莱特林的继承人，也是未来的伏地魔。密室打开后，一名叫桃金娘的女孩被密室中的怪物杀害，魔法部威胁关闭学校。汤姆·里德尔害怕他从此返回麻瓜孤儿院，他没有想到要学校关闭，因此他嫁祸于三年级学生鲁伯·海格和鲁伯·海格养的八眼巨蜘蛛阿拉戈克，导致鲁伯·海格被开除，汤姆·里德尔也因此获得学校的特殊贡献奖。
1991年，由于藏在古灵阁713号金库的魔法石安全受到威胁，校长阿不思·邓布利多将魔法石转移到了霍格沃茨四楼靠右侧走廊下方的密室里，并与其他老师一起设置了防御机关。但时任黑魔法防御术教师奎里纳斯·奇洛（已成为黑巫师，并被伏地魔附身）还是突破了其他老师设置的所有防御机关，而受阻于阿不思·邓布利多亲自布下的厄里斯魔镜前。一年级学生哈利·波特与两个朋友罗恩·韦斯莱、赫敏·格兰杰一起合作，穿越众多机关。哈利·波特与奎里纳斯·奇洛搏斗并守住魔法石，但自己也险些丧命。后来阿不思·邓布利多赶到，救下哈利·波特。魔法石则按照阿不思·邓布利多和尼可·勒梅的意愿被销毁。
1992年，在汤姆·里德尔的日记的影响之下，金妮·韦斯莱被汤姆·里德尔的记忆迷惑，密室由金妮·韦斯莱第二次打开。密室中的怪物袭击并石化了四名麻瓜出身的学生、格兰芬多幽灵“差点没头的尼克”和哑炮管理员阿格斯·费尔奇的猫洛丽丝夫人。原来是卢修斯·马尔福偷偷将汤姆·里德尔的日记放在她的变形术课本里，借此诬陷她的父亲亚瑟·韦斯莱，使亚瑟·韦斯莱出台的麻瓜保护法被否决。但是，哈利·波特和罗恩·韦斯莱发现了真相。哈利·波特摧毁了日记，杀死了密室中的蛇怪，还救出了被汤姆·里德尔的记忆控制进入密室的金妮·韦斯莱。而在校医波比·庞弗雷夫人和草药学教师波莫娜·斯普劳特教授的帮助下，所有被蛇怪石化的人、幽灵和动物都被成功救活。
1993年，由于魔法部认为小天狼星·布莱克逃出巫师监狱阿兹卡班是为了潜入霍格沃茨杀死哈利·波特，所以派遣大批摄魂怪进驻霍格沃茨，而霍格沃茨本身也加强了各种安全措施。但小天狼星·布莱克仍然潜入（因为小天狼星·布莱克是阿尼玛格斯），并躲藏在霍格莫德的尖叫棚屋。之后哈利·波特、罗恩·韦斯莱、赫敏·格兰杰三人同当时的黑魔法防御术教授莱姆斯·卢平（狼人）发现小天狼星·布莱克是无辜的，真正出卖了哈利·波特父母的泄密者是小矮星彼得（阿尼玛格斯），哈利·波特等人抓住了变成老鼠斑斑的小矮星彼得，但当时恰好是月圆之夜，莱姆斯·卢平变身成为狼人，小矮星彼得乘机逃走。后来魔药学教授西弗勒斯·斯内普苏醒后，将哈利·波特等三人和小天狼星·布莱克运回城堡，准备将小天狼星·布莱克交给摄魂怪进行“亲吻”。但是校长阿不思·邓布利多教授相信了哈利·波特和赫敏·格兰杰的说辞，让两人通过时间转换器回到过去，救下将被处决的鹰头马身有翼兽巴克比克。随后哈利·波特用呼神护卫驱逐了大批摄魂怪，救了原来的自己，又和赫敏·格兰杰一起骑上巴克比克，救出小天狼星·布莱克，让他骑着巴克比克逃走了。
1994年，三强争霸赛复办，其中加上了额外几项安全措施，最重要的一项是年龄未满17周岁的学生一律不得参赛。但是，小巴蒂·克劳奇利用复方汤剂伪装成时任黑魔法防御术的教授阿拉斯托·穆迪，将真阿拉斯托·穆迪塞进了他自己的行李箱里。小巴蒂·克劳奇用混淆咒迷惑了火焰杯，将哈利·波特的名字投入火焰杯中，并使他被火焰杯选上。结果，哈利·波特成为了第四个参赛者，同时面对布斯巴顿魔法学校学生、德姆斯特朗魔法学校学生及许多霍格沃茨学生的憎恶。小巴蒂·克劳奇利用种种手段帮助哈利·波特赢得比赛，最后将三强杯变成门钥匙，使哈利·波特和霍格沃茨另外一位勇士塞德里克·迪戈里一触摸奖杯就被送到伏地魔手上。塞德里克·迪戈里惨遭小矮星彼得的杀害，而伏地魔成功利用哈利·波特的血液制成特殊魔药重新恢复肉身。经过一番恶斗后，哈利·波特把塞德里克·迪戈里的遗体带回霍格沃茨学校，小巴蒂·克劳奇见状，意图杀害哈利·波特，结果被阿不思·邓布利多击昏。哈利·波特的陈述和小巴蒂·克劳奇的供词使阿不思·邓布利多知晓了伏地魔成功恢复肉身的消息，但魔法部长康奈利·福吉却拒绝相信，导致阿不思·邓布利多和康奈利·福吉决裂。
1995年，魔法部开始诋毁、抹黑阿不思·邓布利多。多洛雷斯·乌姆里奇，新任黑魔法防御术教师，是这个计划的中心。按照魔法部的指令，多洛雷斯·乌姆里奇在黑魔法防御术教学中，拒绝向学生教授防御符咒的内容，同时蓄意惩罚哈利·波特。在赫敏·格兰杰的谋划下，哈利·波特成立了邓布利多军（简称D.A.），带领一些学生学习被魔法部禁止学生学习的防御符咒。在一连串的教育令之下，多洛雷斯·乌姆里奇出任霍格沃茨高级调查官，慢慢地接管了霍格沃茨学校的各项事务。由于D.A.内部成员的背叛，多洛雷斯·乌姆里奇抓住了D.A.的领头人哈利·波特，阿不思·邓布利多替哈利·波特揽下罪责并逃离霍格沃茨。魔法部通缉阿不思·邓布利多，并由多洛雷斯·乌姆里奇替换阿不思·邓布利多成为校长（但未被学校承认，导致多洛雷斯·乌姆里奇无法进入校长办公室）。之后，她在禁林被马人攻击并虏获。神秘事务司之战后，魔法部长康奈利·福吉接受伏地魔回来了的事实，多洛雷斯·乌姆里奇被停职，阿不思·邓布利多重任校长。
1996年，魔法界的形势十分严峻，伏地魔麾下的食死徒公开进行活动，谋杀、失踪和破坏时常发生。几名食死徒在霍格沃茨六年级学生德拉科·马尔福的安排下进入了学校，攻击了学生和老师。校长阿不思·邓布利多被西弗勒斯·斯内普杀死（西弗勒斯·斯内普是遵照了阿不思·邓布利多的指令）。出于安全的原因，学校面临着被关闭的危险。
1997年，西弗勒斯·斯内普按照伏地魔的指令成为校长，学校继续上课。
不管学校董事会后来作出了什么决定，由于伏地魔接管了魔法部，因此所有少年巫师都必须进入霍格沃茨学习。同时，学校要求学生提供血统证明，表明他们已向魔法部证明自己的巫师血统，才能获准入学。这样，伏地魔就能把所有的巫师从小就置于他的监视之下，同时清除麻瓜出身者，包括那些在收到通知前并不知道自己是巫师的十一岁的孩子。他们可能永远也见不到霍格沃茨，甚至永远也见不到自己的家人。
麻瓜研究变成了必修课程，主要讲述麻瓜们如何卑鄙恶劣。而黑魔法防御术则变成赤裸裸的黑魔法课，要求学生学习使用非法的诅咒。西弗勒斯·斯内普被任命为校长，而阿莱克托和阿米库斯·卡罗则分别成为麻瓜研究和黑魔法课的教师，同时也成为斯内普的副校长。这是一段及其恐怖的时期，没有人有把握说谁是朋友，而谁又是敌人。黑魔法防御术教师由阿米库斯·卡罗接任，麻瓜研究教师则由阿莱克托·卡罗接任（两人均为伏地魔指定的食死徒）。哈利·波特、罗恩·韦斯莱、赫敏·格兰杰三人逃学去寻找并摧毁伏地魔的魂器。后来，哈利·波特回到霍格沃茨，寻找并摧毁剩余魂器，伏地魔得知后，率全部食死徒和巨人赶来，哈利·波特率教师、学生、凤凰社、邓布利多军等奋起抵抗，1998年5月，霍格沃茨保卫战爆发。西弗勒斯·斯内普因老魔杖的归属问题，遭到伏地魔杀害（西弗勒斯·斯内普其实是凤凰社的间谍，为阿不思·邓布利多效力，但伏地魔并不知道这一点），哈利·波特摧毁了全部魂器，在最后决斗中杀死伏地魔，带领众人取得霍格沃茨保卫战的胜利。
和平的曙光终于到来，米勒娃·麦格教授接任校长一职，哈利·波特成为了战后英雄，在战斗中，霍格沃茨城堡被严重破坏。潜逃的黑巫师食死徒仍在逍遥法外，打击余孽，肃清魔法界的工作仍然十分艰巨。
霍格沃茨在战后已经被修复，而在2017年时早已重新开学。米勒娃·麦格还是校长，学校的四个学院仍然存在，许多之前学生的子女也开始进入霍格沃茨上学。纳威·隆巴顿在从傲罗的位置上退下来后成为了学校的草药学教授，还有许多拥有魔法天赋的孩子也被招入院中。
必修课
魔药学：学习制造有魔法效果的混合物。要想正确地制作出魔药，必须正确地混合配料，按照要求搅拌，并把握好合适的时间和适宜的温度。
魔法史：学习关于魔法世界的历史。包括：妖精叛乱、巨人战争、《国际保密法》的起源等。
天文学：与麻瓜世界中的学科完全相同的科目。天文学在天文塔上课，这里是霍格沃茨城堡最高的塔楼。课程的内容包括：使用望远镜观测夜空。天文课每周在午夜时进行，一年级的学生则在星期三上这门课。学生需要学习的内容包括：行星、恒星和星座的名称，以及它们的位置、轨道和环境。观察行星和恒星方位，运动轨迹和各星之间的影响。
草药学：了解魔法植物，并学习如何照料、使用它们，并防止被它们伤害。这门课在霍格沃茨城堡外面的温室进行。
魔咒课：学习一些常用咒语的作用和使用方法。魔咒学的课堂上是出了名的嘈杂和混乱，因为这门课需要大量的实践与练习。魔咒课的教室位于霍格沃茨城堡的三楼。
黑魔法防御术：学习防御型魔法、让自己免受黑魔法和黑暗生物伤害的科目。
变形学：变形术是改变对象形状或外观的魔法分支，而这也是这门课程所介绍的内容。变形学是一门基于理论的科目，教学的咒语包括：转换咒（给对象的一部分变形，比如让人长出兔子耳朵）、消失咒（让对象完全消失）、和召唤咒（让对象凭空产生）等。这类咒语可以把无生命的对象变成有生命的对象，反之亦然。
限定必修课
飞行课：一年级新生的必修课。从如何拿起飞天扫帚开始，学习最基本的飞天扫帚飞行技巧。学校提供二十多把老旧的飞天扫帚，这些扫帚的质量不尽理想，有的飞太高时会瑟瑟发抖，还有的总是微微向左偏。
幻影移行培训班：幻影移形是魔法世界中长途旅行的一种方式。六年级或者七年级的学生才可以选择参加这门课程。在魔法世界中，使用幻影移形需要获得许可，并且只有十七岁以上的巫师才被允许幻影移形。进行这种限制的理由是幻影移形存在一定的危险性：注意力不集中可能导致身体的一部分留在原地，造成称为分体的副作用。正如赫敏·格兰杰多次提到的，施在霍格沃茨城堡和周围场地上的魔法会阻止人在城堡附近幻影移形。当然，这种限制有时会被解除，以便于学生在学校的大礼堂里练习幻影移形。
选修课
占卜课：占卜学是用来预测未来的一个魔法分支。占卜有多种方法和手段，包括：茶叶、火焰预兆、水晶球、手相、纸牌占卜（包括：解读传统的扑克牌和塔罗牌）、占星术和解梦。
算术占卜课：研究数字魔法属性的学科。关于这门课的信息并不多。不过，算术占卜是赫敏·格兰杰最喜欢的课。算数占卜非常难学，因为它要求记忆或使用大量的图表。
保护神奇生物课：指导学生如何照料神奇生物的课程。这门课在城堡外边进行。学习各种神奇生物（例如：弗洛伯毛虫、鹰头马身有翼兽、炸尾螺）的外形、性格和生活习性等。
古代如尼文研究：教授学生古代如尼文的翻译，以及北欧文字的破解，涉及古代魔法咒文与精神力的运用。
麻瓜研究：从“巫师的角度”研究麻瓜的课程。男女巫师了解麻瓜行事方法的目的，是确保他们在需要的时候能够融入其中（比如：在1994年魁地奇世界杯期间）。这门课主要学习了解麻瓜的社会形态，生活方式，以及正确看待和对待麻瓜的态度。也学习怎样正确的和麻瓜进行沟通。（在西弗勒斯·斯内普任校长期间，由于伏地魔掌权，麻瓜研究课改为学习麻瓜的卑劣之处与如何折磨麻瓜）。
N.E.W.Ts提高班
五年级的O.W.Ls考试将会考察所有必修课和学生所选的选修课（至少两门）。成绩达到任课教师要求以上者才可进入N.E.W.Ts提高班（大多数教师的要求都是“良好”，不过西弗勒斯·斯内普教授坚持魔药课要达到“优秀”）。
O.W.Ls考试结束后，将会在同年7月由猫头鹰向学生邮寄考试成绩。根据考试成绩，学生在新学期开始时，同院长商量选课。选课需达到任课老师要求的成绩，还要综合自己的就业理想（学生在五年级第二学期会接受就业指导，了解自己的理想职业所需要学习的课程）。选课完毕后，学生将会得到新课程表，来参加N.E.W.Ts提高班
入学要求
年满11岁的小孩。
不分男女，不分出身，不分血统。
具有魔法天赋。每一个具有魔法天赋的孩子，只要在英国一出生，就会被自动列入了霍格沃茨的招生名单中，当孩子们11岁时就会收到猫头鹰送来的入学通知书（包含入学通知、书单和所需物品清单）
如果不愿入学，也可以留在家中。（《哈利波特与死亡圣器》中，伏地魔掌权时期，魔法部强令巫师子女必须受教于霍格沃茨，且只收有巫师血统的学生。）
分院仪式
分院仪式是霍格沃茨一年一度的仪式，在每个学年开始时进行。这个仪式的目的是将一年级新生分配到学校的四个学院中：格兰芬多、赫奇帕奇、拉文克劳和斯莱特林。在全体新生渡湖来到学校后，他们首先会来到礼堂参加这个仪式，仪式之后则是开学宴会。
分院帽被放在礼堂前面的一个凳子上，它首先会唱一首歌，大概内容是
分院帽
它自己的来历、学校的创始人和不同学院看重的特质。分院帽唱的歌每年都不一样。在发现有必要时，分院帽也会向学生作出警告（可以推测，分院帽会从校长办公室中得到一些信息）。之后，一年级新生会按照名字的字母排序一个接一个地叫到凳子前坐下，并戴上分院帽。分院帽会判断佩戴者最适合哪个学院，并在礼堂中喊出它的决定。分院帽的决定被认为是最终的结果，但是它的决定可以受佩戴者的意愿所影响，分院帽会考虑佩戴者的想法。
期末考试
学生每年只接受一次期末考试，考试合格就可升入下一年级。
合格标准：
O =杰出 Outstanding（优秀）
E =超出期待 Exceeds Expectations（良好）
A =合格 eptable（及格）
（若成绩在A之下，则属于不合格）
P =不佳 Poor（差）
D =糟糕 Dreadful（很差）
T =很糟糕 Troll（极差）
一年级至四年级学生和六年级学生必须要学习所有必修科目，期末考试成绩在合格以上，该课程才能进入下一学年学习，否则会补考甚至留级。
五年级学生必须接受“普通巫师等级”考试；而七年级的毕业生则可以选择参加“终极巫师等级”可能为学生对其解读，其实际展开不详）考试，合格者才能毕业。
万圣节
每年万圣节，霍格沃茨的大礼堂除了会精心布置一番外，更会举行盛大的宴会以庆祝佳节。并且巧合的是，在书中，几乎每一次大事都发生在万圣节期间。
圣诞节