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贼人剿之不尽，这边的贼人剿灭了，那边又有新的贼人出现，在明军眼中，人民军也是贼人。
官府、地主还有这贼人，是老百姓最厌恶的对象，居住在城池内的老百姓还好一些，起码远离贼人，但居住在城外的老百姓就无法避免了，即便是抢走老百姓的粮食，对老百姓们来说就是要了自己命一般。
在人民军之前，要是老百姓遇到好一点的官员，出现贼人后会被迅速派兵剿灭，遇到差一点的官员，只要贼人不做大不惹出大事，官员都不会去管，只是苦了老百姓。
可惜，即便贼人被剿灭了，在官府和地主的压迫下，贼人依旧会源源不断出现，当初受到贼人欺负的老百姓，也有一天成为贼人。
人民军想要将一个县彻底控制住，在攻占县城、剿灭城外地主庄园之后，还要将县内的贼寇全部剿灭，剿灭贼寇也会让人民军得到老百姓的拥戴。
实际上刚开始占领一县的时候，人民军并没有立即清剿贼寇，那些贼寇在发现县城被强大的“贼人”占领后，以为机会到了，立即出山劫掠村庄，还有贼寇竟然找到人民军想要加入。
在这种情况下，人民军才定下剿灭地主庄园后就开始清剿贼寇的步骤，并且在每个村庄招募新兵的时候，新兵会就地训练，并且村庄中没有参军的青壮也要跟着训练，平日里组成护村队，防备有贼寇来袭。
对于少部分从来没有欺负过老百姓的贼寇，人民军以劝降为主，这种贼寇多是因为官府和地主的欺压，才成为贼寇，往往只会对官府和地主大户下手，只不过这种贼寇多数实力较弱，大部分时候都是待在山里种田。
只要贼寇投降，又没有欺负过老百姓，人民军对他们的处理非常宽松，运行他们回到曾经的家园，给所有人分配农田，开始新的生活。
那些欺负过老百姓的贼寇，就算主动加入人民军，人民军也会仔细审查，凡是做过恶的都要被处罚，严重者处死，轻者会送到矿山挖矿，或者进入先登营，没有做过恶的人，可以选择加入人民军，也可以选择回到老家种田。
在清剿贼寇的时候，人民军也有遇到明军的麻烦，贼寇的山寨在大山中，往往易守难攻，看到敌人来袭，会迅速逃往深山，很难清剿掉。
好在人民军原本就是大量山民组成，对山林非常熟悉，而且大部分人民军的衣着都是破旧衣衫，和官军很大不同，山贼看到了还以为是其他伙山贼，人民军可以打个措手不及。
当然，人民军清剿山贼的主力依旧是火器部队，不需要多，只要一个排的火器部队配合上百或者数百冷兵器部队，就能拿下大部分山寨。
要是遇到大股山贼，那人民军就要聚集一个县大部分兵力过去清剿。
新占领的兴宁县、和平县、长宁县、惠来县、普宁县五县，人民军第一混成旅和第二混成旅就是按照这样的步骤对五个县快速控制起来，并且让老百姓迅速接受人民军，一部分老百姓已经已经是真心欢迎人民军的出现。
消化掉这五个县之后，人民军也要尽快发展自身实力，人民军的侦察兵深入到明朝治下活动，已经发现多股明军正在聚集，预计这些明军的目标都会是人民军，用不了多久，人民军与明军的第二场大战就会到来。