虽然团勇们仍然在挨门挨户地搜索，但紫云山一役显然已经进入尾声。
击毙大寨主龙王爷的，自然又是秦王朱由检。前些日从地震废墟中重新寻回了那支燧发手枪，让他如获至宝，这可是他的保命利器！好在手枪本身并没受什么损伤，朱由检便从贺人龙处买来的火药箱中，重新装配了足够的火药。
至于弹丸，就用普通的铁珠。由于手下没有懂得制作弹丸的工匠，朱由检只得采用笨办法。他先让铁匠将锻好的铁分成小块，再一小块一小块地打磨。
这方法极为耗时耗力，几个铁匠忙活了整整一天，才制得了几十发弹丸，而且打磨得还不是特别圆润，只能凑合着使用。
尽管如此，手枪近距离射击的威力，还是人的**无法承受的。朱由检这一枪正轰在龙王爷光溜溜的背上，当即将他的几根肋骨击得粉碎，并且伤及内脏。龙王爷虽有一身武艺，却不是刀枪不入的妖魔鬼怪，也只好心不甘情不愿地一翻白眼，至森罗殿报到去了。
本来大部分土匪就中了砒霜巨毒，即使不死也奄奄一息。大寨主龙王爷一死，众匪就更是群龙无首，哪还有心抵抗，纷纷夺路而逃，企图冲下山去。
可此时，地形这把双刃剑终于显示出它的威力。紫云山三面都是悬崖峭壁，固然是易守难攻。可若攻方断绝下山的道路，上面的人想要下去，也是极为困难。
此时民团已经攻占了寨门，岂容土匪逃脱。团练解勇和众头目在此重兵把守，将推倒的寨门重新立起锁死，人则是站在寨门外面，用几十杆长枪封死去路。
土匪一来，还得先攀爬寨门，往往还没爬到顶部，即被长枪戳得满身窟窿。不一会儿，寨门内就堆满了土匪的死尸，而团勇们则是毫发无伤。
不多时，朱由检和李定国也消灭了残存在寨中的其他土匪，与解勇等人内外夹攻，终于将最后几十名悍匪在寨门附近彻底歼灭。
“胜了！我们又胜了！！！”团勇们的欢呼声响彻山谷，这可是民团成立以来的第一场硬仗！
朱由检马上下令清理战场，救治伤员。
所谓清理战场，其实就是看看还有没有喘气的土匪。如果有，就毫不客气地补上一刀。经过清点，此役连紫云山大寨主龙王爷在内，共斩杀土匪二百六十六人，毒杀五十七人，生俘二十五人。山上的土匪一个都没跑了，被彻底地连锅端了。
而民团方面，也第一次付出了一定的伤亡。其中李定国率领的突击队员共阵亡四人，轻伤二人；朱由检率领的大队人马阵亡一人，重伤三人，轻伤十余人；而解勇带领的断后部队，则是实现了零伤亡。
虽然与土匪相比，民团的伤亡情况微乎其微，可朱由检的心头还是感到一阵沉重。虽说打仗肯定会死人，但眼睁睁地看着战友死去，谁的心里也不好受。尤其是阵亡者的兄弟，更是伏在遗体上大放悲声。
因此朱由检郑重宣布，所有战死的团勇，遗体都要运回秦王庄隆重安葬，并且给予每人一白两银子的高额抚恤金。钱虽然不能让死人复生，但对他的家庭却是实实在在的抚慰。因为这一百两银子对普通家庭来说，已经是一笔巨款，足可支撑十几年的花销了。
至于那些土匪的尸体，朱由检对他们就没那么客气了。由于天气渐渐炎热，尸体腐烂会很快，容易引发疾病的传播。因此朱由检一声令下，众团勇便将这些尸体聚拢在一起，堆起干柴，浇上菜油，再用火折子引燃。
这就是所谓“**”，那火焰登时冲天而起，将数百名土匪的尸体无情地吞噬。刺鼻的气味瞬间弥漫开来，多日以后才逐渐散去。
处理完死的，就该处理活的了。民团这方面的伤员，自是得到了妥善救治，重伤员还得到了二十两银子的救助金。
而那些俘虏的土匪，基本上都是山寨中的最末流，杀人放火这些勾当倒没怎么沾过边。因此朱由检对他们并没有斩尽杀绝，而是将他们牢牢地绑起双手，再用绳子串成一串，准备押解回秦王庄慢慢审问，并让他们互相揭发。
如果确实没有过多作恶，朱由检打算先罚他们做一段时间的苦工，然后就恢复自由。毕竟像这样因活不下去而落草为寇的人还很多，真正应该对这种局面负责的是，不是他们，而是**的朝廷。如果能让他们有活路，这些人还是能成为有用之人的。
除了这些土匪，山寨上还关押了一百多名女子。这些女子都是从附近的村子中抢来的，在山寨中被迫沦为性奴，过着暗无天日的生活。